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【福建,福州市】3批植物样本不同测序方法的建库测序服务
发布时间 2024-10-23 截止日期 立即查看
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招标预告详情

3批植物样本不同测序方法的建库测序服务 发布时间: 2024-10-22 ***省公共资源交易中心 地址 项目概况 受***委托,***对[350001]FJSXH[GK]***、3批植物样本不同测序方法的建库测序服务组织公开招标,现欢迎国内合格的供应商前来参加。3批植物样本不同测序方法的建库测序服务的潜在投标人应在***省政府采购网(zfcg.czt.fujian.gov.cn)免费申请账号在***省政府采购网上公开信息系统按项目获取采购文件,并于******月***日 ***时***分00秒(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号****** 项目名称:3批植物样本不同测序方法的建库测序服务 采购方式:公开招标 预算金额***6,0***元 采购包1(15个植物样本RNA直接测序和三代建库测序服务): 采购包预算金额***0***元 采购包最高限价******元 投标保***元 采购需求:(包括但不限于标的的名称、数量、简要技术需求或服务要求等) 品目号 品目编码及品目名称 采购标的 数量(单位) 允许进口 简要需求或要求 ***元) 中小企业划分标准所属行业 1-1 C***-技术测试和分析服务 15个植物样本RNA直接测序和三代建库测序服务 15(个) 否 (一)技术规格、服务 利用三代测序技术对15个植物样本进行建库测序服务。每个样本做两个RNA直接测序(含甲基化信号)和一个三代三维建库测序,共15个样本。RNA直接测序(含甲基化信号)共计30张芯片,常规物种合格样本下机总数据量不低于10Gb,碱基质量值大于Q7的质控后的碱基数目比例大于总碱基数目的80%;三代三维建库测序,共计15张芯片,原始数据80% 以上碱基质量值在Q20以上。技术参数要求如下: 1、提取:采用多种方法结合提取高质量的DNA,质检合格后用于构建文库; 2、建库:样本质检合格后,对长片段进行切胶回收;对回收的长片段DNA 进行损伤修复、末端修复,对磁珠纯化后的DNA文库进行定量检测。 3、上机:建库完后将质检合格文库和测序缓冲液混合均匀,上机,进行实时单分子测序。 4、质控:采用有效手段将无效数据过滤掉,经过滤接头以及去除低质量的数据得到有效数据。以保证分析的正常进行。 5、报告:对数据产出统计及测序数据的成分和质量评估,开具相应结题报告。 6、数据交付:整个项目周期保证在20个工作日内完成,华为云交付数据文件。 7、售后服务:对于数据问题,供应商应在72小时以内给予应答。承诺项目合同期间及合同期结束后2年内免费提供相关技术咨询与支持服务。 (二)验收要求 对数据产出统计及测序数据的成分和质量评估,开具相应结题报告。整个项目周期保证在20个工作日内完成,云交付数据文件。 品目预算 612,000.00 中小企业划分标准所属行业 其他未列明行业 本采购包不接受联合体投标 合同履行期限:合同签订后15天内完成数据交付 采购包2(若干个植物样本HI-C建库测序服务): 采购包预算金额***0***元 采购包最高限价******元 投标保***元 采购需求:(包括但不限于标的的名称、数量、简要技术需求或服务要求等) 品目号 品目编码及品目名称 采购标的 数量(单位) 允许进口 简要需求或要求 ***元) 中小企业划分标准所属行业 2-1 C***-技术测试和分析服务 若干个植物样本HI-C建库测序服务 1(批) 否 (一)技术规格、服务 采用Illumina和PB HIFI技术测序平台,对134个样本完成HIC和DNA建库和测序工作并对测序数据进行质控/分析。要求如下: 1、提取:针对26个新鲜或冷冻的植物样本进行甲醛交联固定,108个样本进行DNA提取。 2、建库:构建30个 HI-C HindIII 酶切文库,108个DNA文库和3个HIFI文库。 3、上机:基于Illumina技术测序平台进行测序,其中26个样本数据量不少于120Gb,总数据量不少于3600Gb;108个样本数据量不少于16Gb,总数据量不少于1728Gb;HIFI测序3个cell 总数量不少于300Gb。 4、质控:文库有效交联对数均高于80%,Q30>85%。 5、报告:项目结束后的3个工作日内,提供结题报告。 6、数据交付:整个项目保证在20个工作日内完成,华为云交付数据文件。 7、售后服务:成交供应商应为采购人提供7×24小时免费电话咨询服务,并安排指定客服工程师与采购人联系。当样品选择、数据解读等方面出现存疑,成交供应商需在收到相关邮件或电话后于2小时以内予以回应,遇到复杂的问题,3天内提出解决方案。 (二)验收要求 对数据产出统计及测序数据的成分和质量评估,开具相应结题报告。整个项目周期保证在20个工作日内完成,云交付数据文件。 品目预算 390,000.00 中小企业划分标准所属行业 其他未列明行业 本采购包不接受联合体投标 合同履行期限:合同签订后15天内完成数据交付 采购包3( 34个植物样本的Nanopore超长建库测序服务): 采购包预算金额***0***元 采购包最高限价******元 投标保***元 采购需求:(包括但不限于标的的名称、数量、简要技术需求或服务要求等) 品目号 品目编码及品目名称 采购标的 数量(单位) 允许进口 简要需求或要求 ***元) 中小企业划分标准所属行业 3-1 C***-技术测试和分析服务 34个植物样本的Nanopore超长建库测序服务 34(个) 否 (一)技术规格、服务 采用Nanopore PromethION测序平台,对34个样本进行Nanopore超长文库构建,使用R10.4.1芯片进行测序,每个样本测1张芯片。要求如下: 1、提取:DNA提取主带>100kb;DNA提取总量>5ug/cell;DNA提取总量>50ng/ul;纯度要求OD260/280=1.8~2.0、OD260/230=1.6~2.5。 建库:提取高质量基因组DNA,质检合格后打断,进行文库构建并纯化,提供文库质检报告。使用Qubit 进行文库定量并提供Nanopore建库实验流程。 3、上机:使用R10.4.1测序芯片,PromethION sequencer上机测序48~72h,质量要求:pass reads N50 > 100k,Supper模式,raw data产出23G/cell,bascaling使用Q10为阈值,且提供质控报告。 4、质控:原始图像数据经分析转化为原始数据,经过滤得到有效数据,均以FASTQ文件格式存储。去除fail reads得到 passed reads用于后续分析。 5、数据交付:整个项目保证在20个工作日内完成,云链接或硬盘等多种方式灵活交付数据,测序数据有效保存期不低于3个月。 6、报告:对数据产出统计及测序数据的成分和质量评估,开具相应结题报告。 7、售后服务:对于数据问题,供应商应在72小时以内给予应答。承诺项目合同期间及合同期结束后2年内免费提供相关技术咨询与支持服务。 (二)验收要求 对数据产出统计及测序数据的成分和质量评估,开具相应结题报告。整个项目周期保证在20个工作日内完成,云交付数据文件。 品目预算 374,000.00 中小企业划分标准所属行业 其他未列明行业 本采购包不接受联合体投标 合同履行期限:合同签订后15天内完成数据交付 二、申请人的资格要求: 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定; 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: 采购包1:无 采购包2:无 采购包3:无 3.本项目的特定资格要求: 采购包1: (1)采用资格承诺制的供应商,须根据投标(响应)格式文件要求提供资格承诺函,否则,视为未按照招标文件***,按资格审查不合格处理。。 采购包2: (1)采用资格承诺制的供应商,须根据投标(响应)格式文件要求提供资格承诺函,否则,视为未按照招标文件***,按资格审查不合格处理。。 采购包3: (1)采用资格承诺制的供应商,须根据投标(响应)格式文件要求提供资格承诺函,否则,视为未按照招标文件***,按资格审查不合格处理。。 三、采购项目需要落实的政府采购政策 进口产品:不适用本项目 节能产品:不适用本项目 环境标志产品:不适用本项目 四、获取招标文件***: 2024-10-22 至 2024-10-29 ,(提供期限自本公告发布之日起不得少于5个工作日),每天上午00:00:00至12:00:00,下午12:00:00至23:59:59(北京时间,法定节假日除外) 地点:招标文件***;投标人应先在***省政府采购网(zfcg.czt.fujian.gov.cn)免费申请账号在***省政府采购网上公开信息系统按项目下载招标文件(请根据项目所在地,登录对应的(省本级/市级/区县))***省政府采购网上公开信息系统操作),否则投标将被拒绝。 方式:在线获取 售价***、提交投标文件截止时间***、开标时间和地点***(北京时间)(自招标文件***,不得少于***日) 地点:***省***市***区杨***路236号***楼二层房屋开标室 六、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 七、其他补充事宜 八、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名称:*** 地址:***市***区上***路15号 联系方式:***.采购代理机构***(如有) 名称:*** 地址:***省***市***区杨***路236号***楼二层房屋 联系方式:***.项目联系方式 项目联系人***胡非 电话:*** 网址: zfcg.czt.fujian.gov.cn 开户名:*** *** ******月***日 相关附件: 3批植物样本不同测序方法的建库测序服务(***2)-文件集.zip

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