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【福建,福州市】3批植物样本不同测序方法的建库测序服务(二次)

标签：招标预告福建 3批植物样本不同测序方法的建库测序服务(二次)福建农林大学招标信息招标采购

发布时间： 2024-11-15

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招标预告详情

3批植物样本不同测序方法的建库测序服务发布时间： 2024-10-22 ***省公共资源交易中心地址项目概况受***委托，***对[350001]FJSXH[GK]***、3批植物样本不同测序方法的建库测序服务组织公开招标，现欢迎国内合格的供应商前来参加。3批植物样本不同测序方法的建库测序服务的潜在投标人应在***省政府采购网(zfcg.czt.fujian.gov.cn)免费申请账号在***省政府采购网上公开信息系统按项目获取采购文件，并于******月***日 ***时***分00秒（北京时间）前递交投标文件。一、项目基本情况项目编号****** 项目名称：3批植物样本不同测序方法的建库测序服务采购方式：公开招标预算金额***6,0***元采购包1(15个植物样本RNA直接测序和三代建库测序服务): 采购包预算金额***0***元采购包最高限价******元投标保***元采购需求：（包括但不限于标的的名称、数量、简要技术需求或服务要求等）品目号品目编码及品目名称采购标的数量（单位）允许进口简要需求或要求 ***元) 中小企业划分标准所属行业 1-1 C***-技术测试和分析服务 15个植物样本RNA直接测序和三代建库测序服务 15(个) 否（一）技术规格、服务利用三代测序技术对15个植物样本进行建库测序服务。每个样本做两个RNA直接测序（含甲基化信号）和一个三代三维建库测序，共15个样本。RNA直接测序（含甲基化信号）共计30张芯片，常规物种合格样本下机总数据量不低于10Gb，碱基质量值大于Q7的质控后的碱基数目比例大于总碱基数目的80%；三代三维建库测序，共计15张芯片，原始数据80% 以上碱基质量值在Q20以上。技术参数要求如下： 1、提取：采用多种方法结合提取高质量的DNA，质检合格后用于构建文库； 2、建库：样本质检合格后，对长片段进行切胶回收；对回收的长片段DNA 进行损伤修复、末端修复，对磁珠纯化后的DNA文库进行定量检测。 3、上机：建库完后将质检合格文库和测序缓冲液混合均匀，上机，进行实时单分子测序。 4、质控：采用有效手段将无效数据过滤掉，经过滤接头以及去除低质量的数据得到有效数据。以保证分析的正常进行。 5、报告：对数据产出统计及测序数据的成分和质量评估，开具相应结题报告。 6、数据交付：整个项目周期保证在20个工作日内完成，华为云交付数据文件。 7、售后服务：对于数据问题，供应商应在72小时以内给予应答。承诺项目合同期间及合同期结束后2年内免费提供相关技术咨询与支持服务。（二）验收要求对数据产出统计及测序数据的成分和质量评估，开具相应结题报告。整个项目周期保证在20个工作日内完成，云交付数据文件。品目预算 612,000.00 中小企业划分标准所属行业其他未列明行业本采购包不接受联合体投标合同履行期限：合同签订后15天内完成数据交付采购包2(若干个植物样本HI-C建库测序服务): 采购包预算金额***0***元采购包最高限价******元投标保***元采购需求：（包括但不限于标的的名称、数量、简要技术需求或服务要求等）品目号品目编码及品目名称采购标的数量（单位）允许进口简要需求或要求 ***元) 中小企业划分标准所属行业 2-1 C***-技术测试和分析服务若干个植物样本HI-C建库测序服务 1(批) 否（一）技术规格、服务采用Illumina和PB HIFI技术测序平台，对134个样本完成HIC和DNA建库和测序工作并对测序数据进行质控/分析。要求如下： 1、提取：针对26个新鲜或冷冻的植物样本进行甲醛交联固定，108个样本进行DNA提取。 2、建库：构建30个 HI-C HindIII 酶切文库，108个DNA文库和3个HIFI文库。 3、上机：基于Illumina技术测序平台进行测序，其中26个样本数据量不少于120Gb，总数据量不少于3600Gb；108个样本数据量不少于16Gb，总数据量不少于1728Gb；HIFI测序3个cell 总数量不少于300Gb。 4、质控：文库有效交联对数均高于80%，Q30>85%。 5、报告：项目结束后的3个工作日内，提供结题报告。 6、数据交付：整个项目保证在20个工作日内完成，华为云交付数据文件。 7、售后服务：成交供应商应为采购人提供7×24小时免费电话咨询服务，并安排指定客服工程师与采购人联系。当样品选择、数据解读等方面出现存疑，成交供应商需在收到相关邮件或电话后于2小时以内予以回应，遇到复杂的问题，3天内提出解决方案。（二）验收要求对数据产出统计及测序数据的成分和质量评估，开具相应结题报告。整个项目周期保证在20个工作日内完成，云交付数据文件。品目预算 390,000.00 中小企业划分标准所属行业其他未列明行业本采购包不接受联合体投标合同履行期限：合同签订后15天内完成数据交付采购包3( 34个植物样本的Nanopore超长建库测序服务): 采购包预算金额***0***元采购包最高限价******元投标保***元采购需求：（包括但不限于标的的名称、数量、简要技术需求或服务要求等）品目号品目编码及品目名称采购标的数量（单位）允许进口简要需求或要求 ***元) 中小企业划分标准所属行业 3-1 C***-技术测试和分析服务 34个植物样本的Nanopore超长建库测序服务 34(个) 否（一）技术规格、服务采用Nanopore PromethION测序平台，对34个样本进行Nanopore超长文库构建，使用R10.4.1芯片进行测序，每个样本测1张芯片。要求如下： 1、提取：DNA提取主带>100kb；DNA提取总量>5ug/cell；DNA提取总量>50ng/ul；纯度要求OD260/280=1.8~2.0、OD260/230=1.6~2.5。建库：提取高质量基因组DNA，质检合格后打断，进行文库构建并纯化，提供文库质检报告。使用Qubit 进行文库定量并提供Nanopore建库实验流程。 3、上机：使用R10.4.1测序芯片，PromethION sequencer上机测序48~72h，质量要求：pass reads N50 > 100k，Supper模式，raw data产出23G/cell，bascaling使用Q10为阈值，且提供质控报告。 4、质控：原始图像数据经分析转化为原始数据，经过滤得到有效数据，均以FASTQ文件格式存储。去除fail reads得到 passed reads用于后续分析。 5、数据交付：整个项目保证在20个工作日内完成，云链接或硬盘等多种方式灵活交付数据，测序数据有效保存期不低于3个月。 6、报告：对数据产出统计及测序数据的成分和质量评估，开具相应结题报告。 7、售后服务：对于数据问题，供应商应在72小时以内给予应答。承诺项目合同期间及合同期结束后2年内免费提供相关技术咨询与支持服务。（二）验收要求对数据产出统计及测序数据的成分和质量评估，开具相应结题报告。整个项目周期保证在20个工作日内完成，云交付数据文件。品目预算 374,000.00 中小企业划分标准所属行业其他未列明行业本采购包不接受联合体投标合同履行期限：合同签订后15天内完成数据交付二、申请人的资格要求： 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定; 2.落实政府采购政策需满足的资格要求：采购包1：无采购包2：无采购包3：无 3.本项目的特定资格要求：采购包1： (1)采用资格承诺制的供应商，须根据投标(响应)格式文件要求提供资格承诺函，否则，视为未按照招标文件***，按资格审查不合格处理。。采购包2： (1)采用资格承诺制的供应商，须根据投标(响应)格式文件要求提供资格承诺函，否则，视为未按照招标文件***，按资格审查不合格处理。。采购包3： (1)采用资格承诺制的供应商，须根据投标(响应)格式文件要求提供资格承诺函，否则，视为未按照招标文件***，按资格审查不合格处理。。三、采购项目需要落实的政府采购政策进口产品：不适用本项目节能产品：不适用本项目环境标志产品：不适用本项目四、获取招标文件***： 2024-10-22 至 2024-10-29 ，（提供期限自本公告发布之日起不得少于5个工作日），每天上午00:00:00至12:00:00，下午12:00:00至23:59:59（北京时间，法定节假日除外）地点：招标文件***；投标人应先在***省政府采购网(zfcg.czt.fujian.gov.cn)免费申请账号在***省政府采购网上公开信息系统按项目下载招标文件(请根据项目所在地，登录对应的(省本级/市级/区县)）***省政府采购网上公开信息系统操作)，否则投标将被拒绝。方式：在线获取售价***、提交投标文件截止时间***、开标时间和地点***（北京时间）（自招标文件***，不得少于***日）地点：***省***市***区杨***路236号***楼二层房屋开标室六、公告期限自本公告发布之日起5个工作日。七、其他补充事宜八、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。 1.采购人信息名称：*** 地址：***市***区上***路15号联系方式：***.采购代理机构***（如有）名称：*** 地址：***省***市***区杨***路236号***楼二层房屋联系方式：***.项目联系方式项目联系人***胡非电话：*** 网址： zfcg.czt.fujian.gov.cn 开户名：*** *** ******月***日相关附件： 3批植物样本不同测序方法的建库测序服务（***2）-文件集.zip

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